Bonifica logica significa bonifica logica: ripristinare un sistema a uno stato affidabile, non solo rimuovere le tracce evidenti di malware. Va oltre l'eliminazione dei file o il blocco di un IOC. I difensori verificano anche configurazione, privilegi, servizi, relazioni di fiducia e altri comportamenti del sistema rispetto a una baseline nota e attendibile.
Questo è importante perché gli attacchi moderni spesso lasciano tracce parziali, adattive o nascoste. Un endpoint apparentemente pulito può comunque avere elementi di avvio alterati, credenziali compromesse, criteri manomessi o meccanismi di persistenza che i semplici controlli basati sulle firme non rilevano. La bonifica logica viene usata dopo il contenimento per confermare che il sistema si comporti ancora normalmente e che l'attaccante non ne abbia modificato lo stato in modo da sopravvivere a una pulizia di base. È una combinazione pratica di ricerca di IOC, revisione comportamentale e convalida dell'integrità del sistema.