L'elettroforesi capillare è una tecnica di laboratorio usata per separare molecole cariche, inclusi frammenti di DNA, all'interno di un sottile tubo capillare. Un campo elettrico trascina i frammenti attraverso il capillare e, di solito, i pezzi più piccoli viaggiano più velocemente di quelli più grandi. Il risultato è un modello di separazione che può essere letto da un software di analisi.
Nei flussi di lavoro forensi del DNA, l'elettroforesi capillare è importante perché produce i dati grezzi del file che gli strumenti successivi usano per la genotipizzazione e l'interpretazione. Se questi file di output vengono alterati prima dell'analisi, i risultati possono comunque apparire tecnicamente validi mentre la prova sottostante è stata modificata. Questo rende essenziali i controlli di integrità dei file, le restrizioni di accesso e la verifica degli hash. In ambito di sicurezza informatica, il termine è rilevante perché gli attacchi contro questa fase colpiscono la fiducia nei dati stessi, non solo nell'applicazione che li legge.