Il software di interpretazione forense è l'applicazione che legge i risultati di laboratorio e li trasforma in risultati che un analista può esaminare in un contesto investigativo o giudiziario. Nei flussi di lavoro di identificazione umana, può aprire file come dati di traccia o di genotipo, visualizzarli, applicare controlli di qualità e aiutare a generare un rapporto. Si colloca a valle del software dello strumento, quindi dipende dall'integrità dei file che riceve.
Questo è importante perché un file può essere alterato prima di arrivare all'analista e sembrare comunque normale all'interno del programma. Un attacco che modifica i dati in transito potrebbe non bloccare il flusso di lavoro, ma può distorcere l'interpretazione e indebolire il valore probatorio del risultato. I difensori proteggono questo livello con firme digitali, controlli di accesso, registri di audit e procedure di catena di custodia. In pratica, il software di interpretazione forense è sia uno strumento scientifico sia un punto di controllo della sicurezza: è il punto in cui i laboratori confermano che i dati esaminati sono gli stessi prodotti dallo strumento.